Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCPH1Q8NEM0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms