Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13CQ8NE31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM13CQ8NE31 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM13CQ8NE31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms