Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC191Q8NCU4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC191Q8NCU4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms