Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC29Q8NA56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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