Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL1Q8N7R7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms