Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC9Q8N567 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms