Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME8Q8N427 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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