Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms