Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCML4Q8N228 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML4Q8N228 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms