Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf33Q8N1A6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms