Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms