Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMYD4Q8IYR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD4Q8IYR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms