Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY81

FTSJ3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTSJ3Q8IY81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FTSJ3Q8IY81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FTSJ3Q8IY81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms