Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC65Q8IXS2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms