Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM42Q8IWZ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM42Q8IWZ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms