Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN4Q8IWV2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms