Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM4Q8IW00 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM4Q8IW00 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms