Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS6Q8IU80 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS6Q8IU80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms