Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TREML1Q86YW5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 513.5 ms