Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTF1AQ7RTS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTF1AQ7RTS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms