Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP9Q7RTR0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms