Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC80Q76M96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC80Q76M96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC80Q76M96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms