Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms