Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms