Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms