Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SHISA6Q6ZSJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHISA6Q6ZSJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms