Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC73Q6ZRK6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms