Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM1Q6UX27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms