Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms