Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms