Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASC1Q6TDU7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms