Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms