Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAT1Q6PJG6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRAT1Q6PJG6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms