Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3EQ6PEY2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3EQ6PEY2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3EQ6PEY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms