Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZCCHC12Q6PEW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZCCHC12Q6PEW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms