Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G4

TMEM154, Transmembrane protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM154Q6P9G4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM154Q6P9G4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM154Q6P9G4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms