Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLC3Q6P597 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms