Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UFSP1Q6NVU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFSP1Q6NVU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms