Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP4R4Q6NUP7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms