Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCTP1Q6DN14 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms