Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC19Q6DKK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC19Q6DKK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms