Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REP15Q6BDI9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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