Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUPD1Q68J44 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUPD1Q68J44 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms