Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
INTS3Q68E01 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INTS3Q68E01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms