Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX4Q63HM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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