Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHZ3Q63HK5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHZ3Q63HK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ3Q63HK5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms