Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms