Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLX4IPQ5VYV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLX4IPQ5VYV7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms