Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GARNL3Q5VVW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GARNL3Q5VVW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GARNL3Q5VVW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms