Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR78Q5VTH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR78Q5VTH9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms